Правильно – «в двести пятой аудитории». У порядковых числительных изменяется только последнее слово. В данном случае изменяется слово «пятая – пятой»; слово «двести» не меняет своей формы: двести пятая аудитория, в двести пятой аудитории, из двести пятой аудитории.